RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPIND1P05546 499 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TPOP07202 933 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2ADP20671 130 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MAOAP21397 527 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGS2P35354 604 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SCTRP47872 440 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MEOX1P50221 254 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CDKN2DP55273 166 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 AP1S2P56377 157 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SULF2Q8IWU5 870 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM58Q8NG06 486 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 LINGO1Q96FE5 620 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL15Q9NXU5 204 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 URADA6NGE7 173 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HS6ST1O60243 411 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TFEBP19484 476 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GABRB3P28472 473 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 AHRP35869 848 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RFC3P40938 356 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TFF3Q07654 80 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CRYMQ14894 314 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ASB5Q8WWX0 329 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NEIL2Q969S2 332 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL8Q96CD0 374 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM10Q96HG1 83 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MUA0 341 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf51C9J302 202 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PEX1O43933 1283 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GUCA1CO95843 209 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC175P0C221 793 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PGAM1P18669 254 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRNB4P30926 498 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HNF4AP41235 474 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCN2P51788 898 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 IL2P60568 153 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB8AP61006 207 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 REEP5Q00765 189 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HYAL2Q12891 473 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CSHL1Q14406 222 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TERF2Q15554 542 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP1B1Q16678 543 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MDGA2Q7Z553 956 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT7Q86SF2 657 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM156Q8N614 296 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPV3Q8NET8 790 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms