RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 ELP6Q0PNE2 266 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SCARB2Q14108 478 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GPR153Q6NV75 609 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 DNASE1L2Q92874 299 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 POFUT2Q9Y2G5 429 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SOD1P00441 154 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TIMP1P01033 207 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 HLA-EP13747 358 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 IRS1P35568 1242 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TGFBR2P37173 567 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PIK3CBP42338 1070 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 VBP1P61758 197 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 METTL4Q8N3J2 472 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TAMM41Q96BW9 452 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 KCNC2Q96PR1 638 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MROQ9BYG7 248 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ITM2BQ9Y287 266 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 IFNA14P01570 189 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CD36P16671 472 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 C2orf80Q0P641 193 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ADCK1Q86TW2 530 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SLC5A8Q8N695 610 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MYDGFQ969H8 173 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 UBE2E3Q969T4 207 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LGALS12Q96DT0 336 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 COPS4Q9BT78 406 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ITPAQ9BY32 194 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PRNPP04156 253 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CISD3P0C7P0 127 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ITGB8P26012 769 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 DGKGP49619 791 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PRIM2P49643 509 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ERVFC1P60507 584 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 NCS1P62166 190 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TAP2Q03519 686 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 STARD3Q14849 445 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 OXA1LQ15070 435 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MICAQ29983 383 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MFSD4AQ8N468 514 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 SLC38A4Q969I6 547 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 HIDE1A8MVS5 230 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TOR1BO14657 336 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 KRT75O95678 551 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TGFB1P01137 390 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 OPN1SWP03999 348 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 LCKP06239 509 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 WEE1P30291 646 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ST8SIA6P61647 398 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 CDK6Q00534 326 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 RELAQ04206 551 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MPEG1Q2M385 716 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 TRIM16LQ309B1 348 aa14.63□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms