RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		18.94	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	LRIT2	A6NDA9	550 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CHST10	O43529	356 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	JAK1	P23458	1154 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TLE1	Q04724	770 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PCDH1	Q08174	1060 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	E2F2	Q14209	437 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TM9SF4	Q92544	642 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	FAR2	Q96K12	515 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC77	Q9BR77	488 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	AICDA	Q9GZX7	198 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	RHBG	Q9H310	441 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	XPR1	Q9UBH6	696 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TMCO1	Q9UM00	188 aa		18.93	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469		A0A088AWK7	358 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	C4orf51	C9J302	202 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	WFS1	O76024	890 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	FH	P07954	510 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PIK3CG	P48736	1102 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	BTN3A2	P78410	334 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469		Q0VFX4	171 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PCOLCE	Q15113	449 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62	4e-6	■■■□□ 15.5
PSME3-209	ENST00000589469	NADK2	Q4G0N4	442 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MED27	Q6P2C8	311 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CNPY4	Q8N129	248 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	LANCL2	Q9NS86	450 aa		18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	OR2W5	A6NFC9	320 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	DNAJB6	O75190	326 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	SMIM24	O75264	130 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINB1	P30740	379 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	RHAG	Q02094	409 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	OR2L5	Q8NG80	312 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	AGAP4	Q96P64	663 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MFRP	Q9BY79	579 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ACTR8	Q9H981	624 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	SPTA1	P02549	2419 aa		18.91	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469		A0A0G2JN53	185 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINA7	P05543	415 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PRR35	P0CG20	571 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PCNA	P12004	261 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PLA2G16	P53816	162 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	AP2B1	P63010	937 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	TGM3	Q08188	693 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	GTF2H2	Q13888	395 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	LAS2	Q8IYD9	372 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CA13	Q8N1Q1	262 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	PHF21B	Q96EK2	531 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		18.9	■□□□□ 0.62
PSME3-209	ENST00000589469	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	STX16	O14662	325 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	B3GALT2	O43825	422 aa		18.89	■□□□□ 0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms