RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 MTFR2Q6P444 385 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 HORMAD2Q8N7B1 307 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 CCDC120Q96HB5 630 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 FRMD6Q96NE9 622 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 EGFL8Q99944 293 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 HES7Q9BYE0 225 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 KLHL31Q9H511 634 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 CDCP1Q9H5V8 836 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.14■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 EFCAB8A8MWE9 144 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 PRSS44E7EML9 344 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 CCL21O00585 134 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 SLC25A25Q6KCM7 469 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 CA13Q8N1Q1 262 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 ARMC10Q8N2F6 343 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 TRIM31Q9BZY9 425 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 GPAMQ9HCL2 828 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 NECTIN3Q9NQS3 549 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 KLHL1Q9NR64 748 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 RNF14Q9UBS8 474 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.13■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 ZNF835Q9Y2P0 537 aa17.13■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 MLYCDO95822 493 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 GNAZP19086 355 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 MAOAP21397 527 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 GSTM2P28161 218 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 HNF4AP41235 474 aa17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 GAL3ST3Q96A11 431 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 MARVELD3Q96A59 401 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 DERL2Q9GZP9 239 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 SMYD2Q9NRG4 433 aa17.12■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 MMACHCQ9Y4U1 282 aa17.12■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 WDR47O94967 919 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 GDF5P43026 501 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 MRGPRGQ86SM5 289 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 SIAH3Q8IW03 269 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 ZBED8Q8IZ13 594 aa17.11■□□□□ 0.33
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CTIF-206ENST00000588345 BBOF1Q8ND07 529 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 NT5DC2Q9H857 520 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 GPRC5BQ9NZH0 403 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 SNX24Q9Y343 169 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 ABCA12Q86UK0 2595 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 LRBAP50851 2863 aa17.11■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 PCNX1Q96RV3 2341 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 FAM227AF5H4B4 570 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 NME2P1O60361 137 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 NME2P22392 152 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 GGT5P36269 586 aa17.1■□□□□ 0.33
CTIF-206ENST00000588345 CASP6P55212 293 aa17.1■□□□□ 0.33
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