RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-206ENST00000554292 HERVK_113P63132 956 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ADPRMQ3LIE5 342 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 VN1R5Q7Z5H4 357 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 L3MBTL4Q8NA19 623 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 OR2L5Q8NG80 312 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PPP4R1Q8TF05 950 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MS4A6EQ96DS6 147 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SMIM10Q96HG1 83 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 OR1F2PQ96R84 312 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 NTMT1Q9BV86 223 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TMEM109Q9BVC6 243 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ERVK-6Q9BXR3 956 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 KLHL31Q9H511 634 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa26.88■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 COL6A6A6NMZ7 2263 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ERLIN1O75477 346 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CPZQ66K79 652 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 EXD3Q8N9H8 876 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CLEC1AQ8NC01 280 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CENPKQ9BS16 269 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MID2Q9UJV3 735 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MKL2Q9ULH7 1088 aa26.87■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 FOXO6A8MYZ6 492 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 H0YIV9 168 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 DLX3O60479 287 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 OTCP00480 354 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ACPPP15309 386 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PIK3CBP42338 1070 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MINDY4Q4G0A6 757 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TMEM35AQ53FP2 167 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MFSD4BQ5TF39 518 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ADNP2Q6IQ32 1131 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CHSY3Q70JA7 882 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 RDH11Q8TC12 318 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CMTM7Q96FZ5 175 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MS4A8Q9BY19 250 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ROGDIQ9GZN7 287 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MKS1Q9NXB0 559 aa26.86■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SCN2AQ99250 2005 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SOCS6O14544 535 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 OR7A17O14581 309 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 MYL2P10916 166 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 JAK1P23458 1154 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 BTN3A2P78410 334 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SLC18A2Q05940 514 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CHAF1BQ13112 559 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 DCAF10Q5QP82 559 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TRABD2AQ86V40 505 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 LAPTM4BQ86VI4 370 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TMEM151BQ8IW70 566 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 C4orf33Q8N1A6 199 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 METTL21AQ8WXB1 218 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PEX11GQ96HA9 241 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 AICDAQ9GZX7 198 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 FBXL4Q9UKA2 621 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 EMCNQ9ULC0 261 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 STK38LQ9Y2H1 464 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 RNF11Q9Y3C5 154 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SPTA1P02549 2419 aa26.85■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CHST10O43529 356 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 B3GALT2O43825 422 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 SUPT7LO94864 414 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PROCP04070 461 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 RNH1P13489 461 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 IMPDH1P20839 514 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PRKAA2P54646 552 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 NAA20P61599 178 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TRAF3Q13114 568 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 KRT71Q3SY84 523 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 GGTA1PQ4G0N0 100 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF678Q5SXM1 525 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 KIRREL2Q6UWL6 708 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 ZYG11AQ6WRX3 759 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 CCDC63Q8NA47 563 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 OR52B6Q8NGF0 335 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 OR5T3Q8NGG3 340 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 HUS1BQ8NHY5 278 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TBC1D20Q96BZ9 403 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 KCNC2Q96PR1 638 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TRIM55Q9BYV6 548 aa26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PCNX1-206ENST00000554292 PCSK5Q92824 1860 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms