RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71	3e-6	■■■□□ 14.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TTL	Q8NG68	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MZB1	Q8WU39	189 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PHF21B	Q96EK2	531 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	QRFPR	Q96P65	431 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	EPN3	Q9H201	632 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RHBG	Q9H310	441 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	FETUB	Q9UGM5	382 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TBK1	Q9UHD2	729 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	URAD	A6NGE7	173 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3BGRL	O75368	114 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	FH	P07954	510 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PCNA	P12004	261 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PLA2G16	P53816	162 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	BTN3A2	P78410	334 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	KLRB1	Q12918	225 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GTF2H2	Q13888	395 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RUNX2	Q13950	521 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LGSN	Q5TDP6	509 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LAS2	Q8IYD9	372 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CA13	Q8N1Q1	262 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF175	Q8N4F7	328 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	OR7G3	Q8NG95	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TSLP	Q969D9	159 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MTBP	Q96DY7	904 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	F2RL3	Q96RI0	385 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MFRP	Q9BY79	579 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PPM1	405 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM23	A6NLE4	172 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985		A8MT66	165 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	OR7A17	O14581	309 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	B4GALT2	O60909	372 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PRR35	P0CG20	571 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PYGB	P11216	843 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GSTM2	P28161	218 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HSD17B3	P37058	310 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CASR	P41180	1078 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SLCO1A2	P46721	670 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SKP1	P63208	163 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	BTG2	P78543	158 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TLE1	Q04724	770 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MED27	Q6P2C8	311 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71

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