RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	KERA	O60938	352 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DNAJB6	O75190	326 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	FAM155B	O75949	473 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SERPIND1	P05546	499 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CELA2A	P08217	269 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	EPOR	P19235	508 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GLRB	P48167	497 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ARG2	P78540	354 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DLG1	Q12959	904 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PDK4	Q16654	411 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SFT2D3	Q587I9	215 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LGI4	Q8N135	537 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LPAR4	Q99677	370 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CD244	Q9BZW8	370 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	KLHL31	Q9H511	634 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	WWOX	Q9NZC7	414 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	C4orf51	C9J302	202 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CLGN	O14967	610 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	KLK8	O60259	260 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PRMT3	O60678	531 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DDAH2	O95865	285 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	WDPCP	O95876	746 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	B3GALT4	O96024	378 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MYBL2	P10244	700 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MTHFD2	P13995	350 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	EDN3	P14138	238 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TFEB	P19484	476 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	HSPA7	P48741	367 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	RAB8A	P61006	207 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	DOC2A	Q14183	400 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	NR6A1	Q15406	480 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	BTBD16	Q32M84	506 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MNS1	Q8NEH6	495 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	OR2L5	Q8NG80	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ELP5	Q8TE02	316 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	GRHL3	Q8TE85	626 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	QRFPR	Q96P65	431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CS-223	ENST00000551137	CENPE	Q02224	2701 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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