RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	NEK2	P51955	445 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PDX1	P52945	283 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MTTP	P55157	894 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RAB15	P59190	212 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PPP1CA	P62136	330 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CBX1	P83916	185 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RCAN2	Q14206	197 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SQLE	Q14534	574 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NR6A1	Q15406	480 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TCEA2	Q15560	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	IMPG1	Q17R60	797 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ISX	Q2M1V0	245 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GALNTL6	Q49A17	601 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NUDT13	Q86X67	352 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	COQ8B	Q96D53	544 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PPM1M	Q96MI6	270 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TGM7	Q96PF1	710 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SERINC2	Q96SA4	455 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SPRY4	Q9C004	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ACTL8	Q9H568	366 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FGF21	Q9NSA1	209 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HEY2	Q9UBP5	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0J9YVX5	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FEZF1	A0PJY2	475 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PCDH17	O14917	1159 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NDUFS4	O43181	175 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GDF9	O60383	454 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SEC22B	O75396	215 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ATP6AP2	O75787	350 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MYO1D	O94832	1006 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TGFB1	P01137	390 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	IL6	P05231	212 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	PVR	P15151	417 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SDC1	P18827	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MAGEA8	P43361	318 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MNAT1	P51948	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ITGA1	P56199	1179 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	HMGCS1	Q01581	520 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MAP7	Q14244	749 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	SLC9A5	Q14940	896 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	MLC1	Q15049	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	IL23R	Q5VWK5	629 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CPZ	Q66K79	652 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	ADCK2	Q7Z695	626 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM73	Q86UV7	250 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RNF41-208	ENST00000550379	GPR135	Q8IZ08	494 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms