RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.21□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 C5P01031 1676 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0G2JPF8 293 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 PLOD3O60568 738 aa8.2□□□□□ -1.1
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