RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524884.1

BBS1-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 4

Gene BBS1, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-206	ENST00000524884	SYN3	O14994	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FMO6P	O60774	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	GRAP2	O75791	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TIMP1	P01033	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CSF2RA	P15509	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ERCC2	P18074	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	PTPN3	P26045	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	MAGEA11	P43364	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CD151	P48509	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	NUMB	P49757	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ATP4B	P51164	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	PPP5C	P53041	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	RAB10	P61026	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	STX1B	P61266	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	UFM1	P61960	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	NHLH1	Q02575	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FOXM1	Q08050	763 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	MTAP	Q13126	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	STX5	Q13190	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	PCLAF	Q15004	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	PARP15	Q460N3	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884		A0A0U1RQK1	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884		A0A1W2PPC1	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	CTDSP2	O14595	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	TNFSF14	O43557	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	KERA	O60938	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	BANF1	O75531	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	MT-CO3	P00414	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	EPO	P01588	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FGF1	P05230	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	FCGR1A	P12314	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	NRIP1	P48552	1158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS1-206	ENST00000524884	ACADVL	P49748	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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