RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 LHPPQ9H008 270 aa14.85□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 LUZP4Q9P127 313 aa14.85□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 OPTCQ9UBM4 332 aa14.85□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 FLNCQ14315 2725 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 A0A0G2JN53 185 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 URADA6NGE7 173 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 PCDH17O14917 1159 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 CLEC3AO75596 197 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 WISP1O95388 367 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 ALPPP05187 535 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 CYC1P08574 325 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 PCDH1Q08174 1060 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 SLC29A2Q14542 456 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 TEX9Q8N6V9 391 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 CCT6BQ92526 530 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 PSMF1Q92530 271 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.84□□□□□ -0.03
SERF1B-208ENST00000515588 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.84□□□□□ -0.03
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SERF1B-208ENST00000515588 FAM227AF5H4B4 570 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 KLHL41O60662 606 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 PRR35P0CG20 571 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 IL10P22301 178 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 SKP1P63208 163 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 BTN3A2P78410 334 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 FOXK1P85037 733 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 TEX35Q5T0J7 233 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.83□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 AGAP4Q96P64 663 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 QRFPRQ96P65 431 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 XPR1Q9UBH6 696 aa14.83□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 PLAAQ9Y263 795 aa14.83□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 B4GALT2O60909 372 aa14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 SERPINA7P05543 415 aa14.82□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 EPB42P16452 691 aa14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 PLA2G16P53816 162 aa14.82□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 RUNX2Q13950 521 aa14.82□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.82□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 CA13Q8N1Q1 262 aa14.82□□□□□ -0.04
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SERF1B-208ENST00000515588 OR7G3Q8NG95 312 aa14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 MIB2Q96AX9 1013 aa14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 F2RL3Q96RI0 385 aa14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 SCN2AQ99250 2005 aa14.82□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.81□□□□□ -0.04
SERF1B-208ENST00000515588 E2F3O00716 465 aa14.81□□□□□ -0.04
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