RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	SBK2	P0C263	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MYOG	P15173	224 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PRKACG	P22612	351 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CTNNA2	P26232	953 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CTNNB1	P35222	781 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC1A3	P43003	542 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	NME5	P56597	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	BTG1	P62324	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MAPK11	Q15759	364 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	NEDD4	P46934	1319 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802		M0R296	226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ECE2	O60344	883 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LRCH4	O75427	683 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CLN5	O75503	358 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C4BPB	P20851	252 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	HNF4A	P41235	474 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CASP3	P42574	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CLCN4	P51793	760 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	HUNK	P57058	714 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TEF	Q10587	303 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ASPG	Q86U10	573 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SEPT8	Q92599	483 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	AKAP3	O75969	853 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	VDR	P11473	427 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR50	Q13585	617 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT35	Q92764	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	NAPB	Q9H115	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CPA3	P15088	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	EDNRA	P25101	427 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	GIF	P27352	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms