RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 RBBP8Q99708 897 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 PCNX1Q96RV3 2341 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 GNAZP19086 355 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 ST13P50502 369 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
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HOXB3-211ENST00000490677 TRADDQ15628 312 aa26.1■■□□□ 1.77
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HOXB3-211ENST00000490677 TUBA3EQ6PEY2 450 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
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HOXB3-211ENST00000490677 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 MEP1AQ16819 746 aa26.08■■□□□ 1.77
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HOXB3-211ENST00000490677 ZDHHC24Q6UX98 284 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 FRA10AC1Q70Z53 315 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 KIF2BQ8N4N8 673 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXB3-211ENST00000490677 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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HOXB3-211ENST00000490677 NECTIN3Q9NQS3 549 aa26.08■■□□□ 1.77
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HOXB3-211ENST00000490677 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 RELTQ969Z4 430 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 MS4A6EQ96DS6 147 aa26.07■■□□□ 1.76
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HOXB3-211ENST00000490677 PTCHD1Q96NR3 888 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 NT5DC2Q9H857 520 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD10Q9NXR5 420 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
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HOXB3-211ENST00000490677 ADPRMQ3LIE5 342 aa26.06■■□□□ 1.76
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 SAGE2PA6NJ88 616 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 ZG16O60844 167 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 FAM155BO75949 473 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 NEURL1O76050 574 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB3-211ENST00000490677 CRYABP02511 175 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
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HOXB3-211ENST00000490677 STMN1P16949 149 aa26.05■■□□□ 1.76
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