RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA12	P43365	314 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SCTR	P47872	440 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GLRB	P48167	497 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF9	Q00978	393 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS1	Q08116	209 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PCOLCE	Q15113	449 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	RASA2	Q15283	850 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CUZD1	Q86UP6	607 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MREG	Q8N565	214 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PDPR	Q8NCN5	879 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PYCR2	Q96C36	320 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		16.32	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CLGN	O14967	610 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1F1	O43749	312 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM24	O75264	130 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	STK16	O75716	305 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SHBG	P04278	402 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA6	P08185	405 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTA1	P08263	222 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GP1BB	P13224	206 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ALOX12	P18054	663 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAZ	P19086	355 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GNLY	P22749	145 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GCA	P28676	217 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	XCR1	P46094	333 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SLCO1A2	P46721	670 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	DLG1	Q12959	904 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD13	Q7L211	337 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CROCCP2	Q86T23	111 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NEIL2	Q969S2	332 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EHD1	Q9H4M9	534 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NT5DC2	Q9H857	520 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FEZF1	A0PJY2	475 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL18	O94889	574 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	TAC1	P20366	129 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	JAK1	P23458	1154 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	REEP5	Q00765	189 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EXT1	Q16394	746 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX31	Q8N9S9	440 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	KCT2	Q8NC54	265 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	M1AP	Q8TC57	530 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf44	Q96CB5	159 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CD244	Q9BZW8	370 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	16.3	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	WIPF3	A6NGB9	483 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	UBXN8	O00124	270 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MASP2	O00187	686 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFS4	O43181	175 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	IL1RN	P18510	177 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A12	P48065	614 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT5	P48643	541 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3CG	P48736	1102 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA7	P48741	367 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC16	Q13042	620 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT16	Q17RD7	645 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PDSS2	Q86YH6	399 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	LGI4	Q8N135	537 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		16.29	■□□□□ 0.2
HDAC10-216	ENST00000489424	FAR1	Q8WVX9	515 aa		16.29	■□□□□ 0.2

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