RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TM9SF4Q92544 642 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NEIL2Q969S2 332 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR4K3Q96R72 315 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TAAR6Q96RI8 345 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR22Q99680 433 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RBBP8Q99708 897 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 EGFL8Q99944 293 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXC2Q99958 501 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SARGQ9BW04 601 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 DERL2Q9GZP9 239 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PELI2Q9HAT8 420 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OARD1Q9Y530 152 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GTF3C1Q12789 2109 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ESYT3A0FGR9 886 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFS4O43181 175 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNHIT1O43257 154 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 OR1F1O43749 312 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 BMP10O95393 424 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 C1QAP02745 245 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CYC1P08574 325 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC166P0CW27 439 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 COX6A1P12074 109 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 STMN1P16949 149 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 IL1RNP18510 177 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CXCR2P25025 360 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MST1P26927 711 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SPRP35270 261 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CA7P43166 264 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEA4P43358 317 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SCTRP47872 440 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 REEP5Q00765 189 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC7A5Q01650 507 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RGS1Q08116 209 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NAB1Q13506 487 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PWP1Q13610 501 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 HERC3Q15034 1050 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TGFBIQ15582 683 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TRADDQ15628 312 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SYT16Q17RD7 645 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 GRTP1Q5TC63 336 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 PPM1NQ8N819 430 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 KCT2Q8NC54 265 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 FBF1Q8TES7 1133 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 C8orf44Q96CB5 159 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AGAP4Q96P64 663 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 LHPPQ9H008 270 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.06□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.06□□□□□ -1.44
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