RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 GABRR3A8MPY1 467 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS44E7EML9 344 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 E2F3O00716 465 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ZNHIT1O43257 154 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 MAN1A2O60476 641 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 IFNA16P05015 189 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PCNAP12004 261 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 GNAZP19086 355 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 MST1P26927 711 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 GMPRP36959 345 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 DCTP40126 519 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 CD96P40200 585 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SCTRP47872 440 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA7P48741 367 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PLA2G16P53816 162 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PLTPP55058 493 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 RBPJQ06330 500 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SLC13A2Q13183 592 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 OR1C1Q15619 314 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 XKR6Q5GH73 641 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 STEAP4Q687X5 459 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 KRT78Q8N1N4 520 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PPM1NQ8N819 430 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 TRPV3Q8NET8 790 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 NR4A3Q92570 626 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 OR1F2PQ96R84 312 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 RHOJQ9H4E5 214 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 PELI2Q9HAT8 420 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 RNF112Q9ULX5 631 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RAD51CO43502 376 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 B3GALT2O43825 422 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SUPT3HO75486 399 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM155BO75949 473 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MYO1DO94832 1006 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 STMN1P16949 149 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TNNI3P19429 210 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 AHRP35869 848 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RFC3P40938 356 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC26A5P58743 744 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 REEP5Q00765 189 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 POU4F1Q01851 419 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RHAGQ02094 409 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TUBA3CQ13748 450 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GALNT7Q86SF2 657 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM156Q8N614 296 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM47BQ8NA70 645 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 M1APQ8TC57 530 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NT5CQ8TCD5 201 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MAGED4Q96JG8 741 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.58□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ERP44Q9BS26 406 aa7.58□□□□□ -1.2
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