RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 ALOX12P18054 663 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TFEBP19484 476 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 HNF4AP41235 474 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SCTRP47872 440 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 MEOX1P50221 254 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 GPR85P60893 370 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 RUNX2Q13950 521 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 XKR6Q5GH73 641 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 C4orf22Q6V702 233 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CEP128Q6ZU80 1094 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CD163Q86VB7 1156 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 C17orf64Q86WR6 236 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CEP97Q8IW35 865 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 LGI4Q8N135 537 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 GHDCQ8N2G8 530 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TMEM178AQ8NBL3 297 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 MCUQ8NE86 351 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 NT5CQ8TCD5 201 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 NEIL2Q969S2 332 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PWWP2AQ96N64 755 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PTCHD1Q96NR3 888 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 OR1F2PQ96R84 312 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PARVBQ9HBI1 364 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ZFATQ9P243 1243 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PPT2Q9UMR5 302 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 LIPGQ9Y5X9 500 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 HCFC1P51610 2035 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 AP3B1O00203 1094 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 NDUFS4O43181 175 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 OR1F1O43749 312 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PDE9AO76083 593 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ABOP16442 354 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ZNF24P17028 368 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 HRH2P25021 359 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 HLCSP50747 726 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 AP2B1P63010 937 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 REEP5Q00765 189 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SBSNQ6UWP8 590 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 QSOX2Q6ZRP7 698 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CYP4X1Q8N118 509 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CA13Q8N1Q1 262 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SLC5A8Q8N695 610 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ZNF321PQ8N8H1 164 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 C16orf52Q8NHV5 167 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 FAM57AQ8TBR7 257 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 LINGO1Q96FE5 620 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SNF8Q96H20 258 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 RNF6Q9Y252 685 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 A0A0G2JN53 185 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TRBC2A0A5B9 178 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PEX1O43933 1283 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SERPIND1P05546 499 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PAMP19021 973 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PTGS2P35354 604 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CYB561P49447 251 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CASP6P55212 293 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 DLX5P56178 289 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 NUP107P57740 925 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PWP1Q13610 501 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CRYMQ14894 314 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 CYP1B1Q16678 543 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 RTL6Q6ICC9 239 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 VN1R5Q7Z5H4 357 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 SCUBE1Q8IWY4 988 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 MCOLN3Q8TDD5 553 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 POM121Q96HA1 1249 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TSNARE1Q96NA8 513 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 DEFB127Q9H1M4 99 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 RHBGQ9H310 441 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 LIME1Q9H400 295 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 GPAMQ9HCL2 828 aa10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
NISCH-206ENST00000474188 MAGEB16A2A368 324 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms