RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.19■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.19■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PADI1Q9ULC6 663 aa15.19■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.19■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 C4orf51C9J302 202 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ITGAXP20702 1163 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 HTR6P50406 440 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 OCRLQ01968 901 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 DSG2Q14126 1118 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RNF175Q8N4F7 328 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 CKAP2Q8WWK9 683 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NKD1Q969G9 470 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 FKBP10Q96AY3 582 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RGMAQ96B86 450 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MAGEB18Q96M61 343 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 F2RL3Q96RI0 385 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 CCT7Q99832 543 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 C20orf27Q9GZN8 174 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 OR51B5Q9H339 312 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.18■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NPIPB8E9PQR5 432 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 KLHL18O94889 574 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 SCELO95171 688 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ETHE1O95571 254 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ALBP02768 609 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 CD63P08962 238 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 IL1RNP18510 177 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 STAT5AP42229 794 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RPL14P50914 215 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RAB8AP61006 207 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 SGO1Q5FBB7 561 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 C1orf189Q5VU69 101 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PDSS2Q86YH6 399 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ZNF781Q8N8C0 355 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MR1Q95460 341 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 FAR2Q96K12 515 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 QRFPRQ96P65 431 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 AHSPQ9NZD4 102 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 VPS29Q9UBQ0 182 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.17■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 C21orf140B9A014 251 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 C9J4A7 227 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PLPP1O14494 284 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PRPH2P23942 346 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 SERPINB3P29508 390 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 RAP1GDS1P52306 607 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PLA2G16P53816 162 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MTTPP55157 894 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 DEFB134Q4QY38 66 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 COX15Q7KZN9 410 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 METTL4Q8N3J2 472 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 AMER3Q8N944 861 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 C7orf26Q96N11 449 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 SERINC2Q96SA4 455 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 ACPTQ9BZG2 426 aa15.16■□□□□ 0.02
GPC1-207ENST00000466624 DPH1Q9BZG8 443 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms