RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MVB12AQ96EY5 273 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZPBPQ9BS86 351 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NDC1Q9BTX1 674 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL31Q9H511 634 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNK13Q9HB14 408 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MRGBPQ9NV56 204 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PIEZO1Q92508 2521 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 AGRPO00253 132 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PLPP1O14494 284 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFAB1O14561 156 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PLD2O14939 933 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 UBDO15205 165 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR35P0CG20 571 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL4P13236 92 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SSR2P43308 183 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GSTM5P46439 218 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 AVPR1BP47901 424 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MTTPP55157 894 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB8AP61006 207 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 BTN3A2P78410 334 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CBX1P83916 185 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0040Q15053 153 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT13Q86X67 352 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 BMPERQ8N8U9 685 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf82Q8WW14 230 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 APIPQ96GX9 242 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM10Q96HG1 83 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52B2Q96RD2 323 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TAAR9Q96RI9 348 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SERINC2Q96SA4 455 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 EBF4Q9BQW3 602 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 STARD5Q9NSY2 213 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 CUTCQ9NTM9 273 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MCM8Q9UJA3 840 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YIG0 161 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF749O43361 778 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 B3GALT2O43825 422 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDH7O60245 1069 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 GUCY1B2O75343 617 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SCRG1O75711 98 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHL18O94889 574 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-208ENST00000462602 SCELO95171 688 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms