RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 HPS6Q86YV9 775 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT78Q8N1N4 520 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP5-208ENST00000459627 GPR78Q96P69 363 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP5-208ENST00000459627 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.51■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa22.48■■□□□ 1.19
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SH3BP5-208ENST00000459627 VPS4BO75351 444 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 CLEC3AO75596 197 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 RNH1P13489 461 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 CERS1P27544 350 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 GCAP28676 217 aa22.47■■□□□ 1.19
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