RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF225Q9UK10 706 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-202ENST00000406506 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXD12-202ENST00000406506 VSTM2BA6NLU5 285 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 RECKO95980 971 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 FURINP09958 794 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MYZAPP0CAP1 466 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PIK3CBP42338 1070 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SKP1P63208 163 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 LCP2Q13094 533 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ERV3-1Q14264 604 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 UGT8Q16880 541 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 LIPMQ5VYY2 423 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 RNF175Q8N4F7 328 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SMIM10Q96HG1 83 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 DMRT3Q9NQL9 472 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 HCN3Q9P1Z3 774 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 TRPS1Q9UHF7 1281 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ADGRE2Q9UHX3 823 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ATRXP46100 2492 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 CDC14CA4D256 554 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MLYCDO95822 493 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 UMODP07911 640 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 OCA2Q04671 838 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 NIPAL1Q6NVV3 410 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 HDXQ7Z353 690 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 C10orf107Q8IVU9 208 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 OR2L5Q8NG80 312 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 OR5T3Q8NGG3 340 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 F2RL3Q96RI0 385 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 VIPAS39Q9H9C1 493 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 A0A0G2JN53 185 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 OR4F21O95013 312 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ETV4P43268 484 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 NAGLUP54802 743 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 NAA20P61599 178 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PHEXP78562 749 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 KLC1Q07866 573 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 VWA2Q5GFL6 755 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PRSS58Q8IYP2 241 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SHISA5Q8N114 240 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MIEF2Q96C03 454 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MECRQ9BV79 373 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 YIPF2Q9BWQ6 316 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PRM3Q9NNZ6 103 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SH3BGRLO75368 114 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 TGFB1P01137 390 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ALDH3A1P30838 453 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 XCR1P46094 333 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PLA2G16P53816 162 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PKNOX1P55347 436 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 RPS13P62277 151 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 OLR1P78380 273 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 CFAP157Q5JU67 520 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 FRG2Q64ET8 278 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 RAB43Q86YS6 212 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 AGAP11Q8TF27 550 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 QRFPRQ96P65 431 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 FRG2BQ96QU4 278 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 PPT2Q9UMR5 302 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 LHX6Q9UPM6 363 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD12-202ENST00000406506 POLHQ9Y253 713 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms