RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397912.3

PRKRIP1-201, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKRIP1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-201ENST00000397912 TNFRSF1BP20333 461 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 IMPA1P29218 277 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 UGT2B15P54855 530 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SP3Q02447 781 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF385BQ569K4 471 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 GAREM2Q75VX8 874 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 OXR1Q8N573 874 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 GPR156Q8NFN8 814 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TMEM159Q96B96 161 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 REPS1Q96D71 796 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 EHD1Q9H4M9 534 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 MKLN1Q9UL63 735 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.61□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 IFNA14P01570 189 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 XCR1P46094 333 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 OR1E2P47887 323 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 LIMS1P48059 325 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PRIM2P49643 509 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SEPHS1P49903 392 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SYTL3Q4VX76 610 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 MED27Q6P2C8 311 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 AKAP14Q86UN6 197 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CHST14Q8NCH0 376 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TMEM169Q96HH4 297 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TCF25Q9BQ70 676 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CENPOQ9BU64 300 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ACER3Q9NUN7 267 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 WASH3PC4AMC7 463 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SNPHO15079 494 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 NPC1O15118 1278 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 MPZL2O60487 215 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SH3BGRLO75368 114 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 KCNK2O95069 426 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 DLGAP3O95886 979 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 VIPR1P32241 457 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CDC42P60953 191 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PDE7AQ13946 482 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PKP4Q99569 1192 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PIP5K1AQ99755 562 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF197O14709 1029 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 TSPAN6O43657 245 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CXCL10P02778 98 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 URODP06132 367 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SOX6P35712 828 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CDK6Q00534 326 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 Q6ZVL8 140 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 Q6ZVU0 165 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 NEIL2Q969S2 332 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CTRCQ99895 268 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKRIP1-201ENST00000397912 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms