RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HDDC3Q8N4P3 179 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MEIOBQ8N635 442 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 KLK6Q92876 244 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCRN2Q96FV2 425 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LAMB2P55268 1798 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCAMP1O15126 338 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 B3GALT2O43825 422 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RASGRP1O95267 797 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CARM1Q86X55 608 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB8BQ92930 207 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MARCH7Q9H992 704 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PHF24Q9UPV7 400 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC72A6NJI9 287 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PSKH1P11801 424 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC14A2Q15849 920 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TP53INP1Q96A56 240 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DIABLOQ9NR28 239 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZSCAN32Q9NX65 697 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM170BA6NMN3 283 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 AOC2O75106 756 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PRAMEF12O95522 483 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 23.2
PTPRN2-201ENST00000389413 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LIN54Q6MZP7 749 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC15A4Q8N697 577 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CITED4Q96RK1 184 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1B0GVG6 124 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SPINT3P49223 89 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ERVK-21P61565 698 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ST3GAL3Q11203 375 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IQCHQ86VS3 1027 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NCSTNQ92542 709 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GORASP2Q9H8Y8 452 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A0U1RQS6 177 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ISPDA4D126 451 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 AGR2O95994 175 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC6A4P31645 630 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 APIPQ96GX9 242 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FEVQ99581 238 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GRM2Q14416 872 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 PDGFRLQ15198 375 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GALNT10Q86SR1 603 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF563Q8TA94 476 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR151Q8TDV0 419 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 INPP5KQ9BT40 448 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 OR5P2Q8WZ92 322 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SPACA7Q96KW9 195 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HHLA1C9JL84 531 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HCN1O60741 890 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 FGF18O76093 207 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 HLA-DPB1P04440 258 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 LAMP1P11279 417 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 ITPKBP27987 946 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC5A2P31639 672 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CDK5R2Q13319 367 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms