RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 LDAHQ9H6V9 325 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 IFT46Q9NQC8 304 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 MARK1Q9P0L2 795 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.96□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 E7ESA3 106 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 PSMD9O00233 223 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 C6P13671 934 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 HSD3B1P14060 373 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CD1DP15813 335 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 HSD3B2P26439 372 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 NPTX1Q15818 432 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 RNF130Q86XS8 419 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 FOXJ1Q92949 421 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 SCRN2Q96FV2 425 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 TRIB3Q96RU7 358 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CST11Q9H112 138 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf21Q9H246 121 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 OR6C74A6NCV1 312 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 FABP12A6NFH5 140 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 DIRAS1O95057 198 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 SLC6A4P31645 630 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 SPINT3P49223 89 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 OR12D2P58182 307 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CYS1Q717R9 158 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 NR4A3Q92570 626 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 MOAP1Q96BY2 351 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 BIRC7Q96CA5 298 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 MCHR1Q99705 422 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 DUX1O43812 170 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 APBB3O95704 486 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CH25HO95992 272 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CD36P16671 472 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 PFKLP17858 780 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 HSD11B1P28845 292 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 OXTRP30559 389 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 KCNC1P48547 511 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 VBP1P61758 197 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 IDNKQ5T6J7 187 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 NAT14Q8WUY8 206 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 OARD1Q9Y530 152 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CITO14578 2027 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1W2PRQ8 180 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 TP53I11O14683 189 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 TNFRSF10BO14763 440 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ITGB1P05556 798 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 IFI30P13284 250 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 FOSL2P15408 326 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CD70P32970 193 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 PTGR1Q14914 329 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ARL9Q6T311 187 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CEP97Q8IW35 865 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 FBRSQ9HAH7 460 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 UPB1Q9UBR1 384 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 GPR34Q9UPC5 381 aa9.95□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CNMDO75829 334 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 GLDCP23378 1020 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ACADVLP49748 655 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 MTTPP55157 894 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CLDN10P78369 228 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 GSTM4Q03013 218 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 BLMHQ13867 455 aa9.94□□□□□ -0.82
ZNF548-202ENST00000366197 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms