RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 HHATLQ9HCP6 504 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCB9Q9NP78 766 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 STC2O76061 302 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CKBP12277 381 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 E2F2Q14209 437 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 APCDD1Q8J025 514 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.39■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 E9PQ18 207 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 FZD6O60353 706 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENTPD6O75354 484 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX4O95219 450 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFI30P13284 250 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MC1RQ01726 317 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRPS1L1P21108 318 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSKP41240 450 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MTAPQ13126 283 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF385BQ569K4 471 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MED8Q96G25 268 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAPNS2Q96L46 248 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS35Q96QK1 796 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 VWA8A3KMH1 1905 aa20.38■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 E7EQ34 232 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLD2O14939 933 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 KPNA5O15131 536 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF10O60809 474 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 XKR6Q5GH73 641 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C11orf74Q86VG3 221 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TET1Q8NFU7 2136 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIK3R3Q92569 461 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 UROC1Q96N76 676 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A0X1KG70 313 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 GASTP01350 101 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP17A1P05093 508 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP2A7P20853 494 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 IRF8Q02556 426 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR65Q8IYL9 337 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 NXPE1Q8N323 547 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PKP4Q99569 1192 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFL2Q9Y281 166 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A0G2JMP0 313 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 AKR7A2O43488 359 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNF4AP41235 474 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMU1Q2TAY7 513 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERAP2Q6P179 960 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF180Q86T96 592 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX18Q96RF0 628 aa20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1B0GVM2 712 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MICAQ29983 383 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SELENOWP63302 87 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CPTPQ5TA50 214 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYT14Q8NB59 555 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF170Q96K19 258 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB23Q9ULC3 237 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.36■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCNB2O95067 398 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHMP24386 653 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HTR2BP41595 481 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms