RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 DPP6P42658 865 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A9P48067 706 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SEPHS1P49903 392 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ACTA2P62736 377 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ACTG2P63267 376 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CDH11P55287 796 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 HERV-K104P61576 105 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GRIK2Q13002 908 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 TEAD2Q15562 447 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF559Q9BR84 538 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ITM2AO43736 263 aa6.97□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 UGT1A4P22310 534 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GRK5P34947 590 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC11A1P49279 550 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 PHF19Q5T6S3 580 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.97□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 GNG8Q9UK08 70 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HYKKA2RU49 373 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PSMD9O00233 223 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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