RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
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RABGGTA-201ENST00000216840 PDP2Q9P2J9 529 aa16.46■□□□□ 0.23
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RABGGTA-201ENST00000216840 ACTR1AP61163 376 aa16.46■□□□□ 0.22
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.45■□□□□ 0.22
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RABGGTA-201ENST00000216840 NUDT13Q86X67 352 aa16.44■□□□□ 0.22
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RABGGTA-201ENST00000216840 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.44■□□□□ 0.22
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RABGGTA-201ENST00000216840 GPATCH2Q9NW75 528 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1W2PRB8 838 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 LRIT2A6NDA9 550 aa16.43■□□□□ 0.22
RABGGTA-201ENST00000216840 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.43■□□□□ 0.22
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