RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 GPR17Q13304 367 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 P2RY14Q15391 338 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 UBE2SQ16763 222 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 TTC38Q5R3I4 469 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ARTNQ5T4W7 220 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 VASNQ6EMK4 673 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 UQCC3Q6UW78 93 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 USP30Q70CQ3 517 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SMIM5Q71RC9 77 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.99□□□□□ -1.45
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SAMMSON-210ENST00000641260 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SVBPQ8N300 66 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF283Q8N7M2 679 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 BVESQ8NE79 360 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SNX33Q8WV41 574 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 CYGBQ8WWM9 190 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ING5Q8WYH8 240 aa5.99□□□□□ -1.45
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SAMMSON-210ENST00000641260 KAT5Q92993 513 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 FAF2Q96CS3 445 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 YIPF6Q96EC8 236 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF599Q96NL3 588 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 CASD1Q96PB1 797 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 HBEGFQ99075 208 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 RAD9AQ99638 391 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SOX7Q9BT81 388 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 REG4Q9BYZ8 158 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SRRQ9GZT4 340 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PDE7BQ9NP56 450 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 NRBP2Q9NSY0 501 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 OPTCQ9UBM4 332 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 TCFL5Q9UL49 500 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PDE10AQ9Y233 779 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 U3KQV3 271 aa5.99□□□□□ -1.45
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SAMMSON-210ENST00000641260 A0A0A0MRY4 1105 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.98□□□□□ -1.45
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SAMMSON-210ENST00000641260 A6NIZ1 184 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 DRGXA6NNA5 263 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PDCD5O14737 125 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 FSCN2O14926 492 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 MID1O15344 667 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 FRS3O43559 492 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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SAMMSON-210ENST00000641260 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 RAD17O75943 681 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 RECQL4O94761 1208 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDH8O95206 1070 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 GADD45GO95257 159 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 HPRP00739 348 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 CSF2P04141 144 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 CD3GP09693 182 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 CETPP11597 493 aa5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SAMMSON-210ENST00000641260 NPR2P20594 1047 aa5.98□□□□□ -1.45
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