RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 GSTM5P46439 218 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 DAPP51397 102 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 VLDLRP98155 873 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 IL1RL1Q01638 556 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CDK5R2Q13319 367 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 NFE2L1Q14494 772 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 C17orf64Q86WR6 236 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ZNF547Q8IVP9 402 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 QRFPRQ96P65 431 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 B4GAT1O43505 415 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 SEMA3DO95025 777 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 NTRK1P04629 796 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 EPHX1P07099 455 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 JUNDP17535 347 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 METAP1P53582 386 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 RAPSNQ13702 412 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 GAB4Q2WGN9 574 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 IFI44LQ53G44 452 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 XAF1Q6GPH4 301 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 PNCKQ6P2M8 343 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CEP68Q76N32 757 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 VTCN1Q7Z7D3 282 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 NAGSQ8N159 534 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 OR51B5Q9H339 312 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 VNN3Q9NY84 501 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 C5orf42Q9H799 3197 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 A0A1W2PRB8 838 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ATE1O95260 518 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 C6orf47O95873 294 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 P2RY2P41231 377 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TAS2R50P59544 299 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 HBA1P69905 142 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 KCNJ10P78508 379 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 GAB1Q13480 694 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 CCDC80Q76M96 950 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 SVOPQ8N4V2 548 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 FGF13Q92913 245 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 C7orf34Q96L11 122 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 LHPPQ9H008 270 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 RHBGQ9H310 441 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 NT5DC2Q9H857 520 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 PSME2Q9UL46 239 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 KMOO15229 486 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TBX19O60806 448 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TNFRSF21O75509 655 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 KLK1P06870 262 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 ERGP11308 486 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 UQCRC2P22695 453 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 TEAD1P28347 426 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 IL12RB1P42701 662 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 MVKQ03426 396 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 SCARB2Q14108 478 aa11.62□□□□□ -0.55
CLN8-212ENST00000637083 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms