RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 TBCCQ15814 346 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 HPS6Q86YV9 775 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 EFCAB11Q9BUY7 163 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 VPS11Q9H270 941 aa23.55■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 KLK8O60259 260 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 RDH16O75452 317 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 SMIM10L1P0DMW3 83 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 EPORP19235 508 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 CASP2P42575 452 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 XCR1P46094 333 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 PCDH1Q08174 1060 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 SMIM10Q96HG1 83 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 MESP1Q9BRJ9 268 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 HCN3Q9P1Z3 774 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 C5AR2Q9P296 337 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 MKL2Q9ULH7 1088 aa23.54■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 TRIM49D1C9J1S8 452 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 K7EPI3 171 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 MASP2O00187 686 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 HPP00738 406 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 COL6A2P12110 1019 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 IL10P22301 178 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 CASRP41180 1078 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 AGTR2P50052 363 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 DOC2AQ14183 400 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 DEFB134Q4QY38 66 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 XKR6Q5GH73 641 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 TEX35Q5T0J7 233 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 TMEM205Q6UW68 189 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 TEX19Q8NA77 164 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 OPTCQ9UBM4 332 aa23.53■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 GCAP28676 217 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF8P28908 595 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 EFNA3P52797 238 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 LAPTM5Q13571 262 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 SETDB1Q15047 1291 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 TECRLQ5HYJ1 363 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 LGSNQ5TDP6 509 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 C8orf44Q96CB5 159 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 OR1F2PQ96R84 312 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 VN1R1Q9GZP7 353 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 FETUBQ9UGM5 382 aa23.52■■□□□ 1.36
PMS1-220ENST00000618056 ALOX12BO75342 701 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 JRKO75564 520 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CLEC3AO75596 197 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 WFS1O76024 890 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ALPPP05187 535 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 COX6A1P12074 109 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CD22P20273 847 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 IRF8Q02556 426 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CHIT1Q13231 466 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RAPSNQ13702 412 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 SLC29A2Q14542 456 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 PAGE2BQ5JRK9 111 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TENM4Q6N022 2769 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 NDUFAF7Q7L592 441 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 SHISA5Q8N114 240 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 AICDAQ9GZX7 198 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RHBGQ9H310 441 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 KLHL31Q9H511 634 aa23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ZNF860A6NHJ4 632 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 RBP1P09455 135 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 MYBL2P10244 700 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 GFAPP14136 432 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ITGA3P26006 1051 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 CNPY4Q8N129 248 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 OR5T3Q8NGG3 340 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 MTBPQ96DY7 904 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ZNF358Q9NW07 568 aa23.5■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 LRIT2A6NDA9 550 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 ANKDD1BA6NHY2 528 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 J3QKU1 62 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 DPM1O60762 260 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 C8orf89P0DMQ9 161 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 EPB42P16452 691 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-220ENST00000618056 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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