RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	EID3	Q8N140	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RND1	Q92730	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	APIP	Q96GX9	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LHPP	Q9H008	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768		E5RJQ4	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	AGPS	O00116	658 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	AP4M1	O00189	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK13	O15264	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SNX2	O60749	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	APOE	P02649	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF30	P17039	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ATIC	P31939	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CTSC	P53634	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	NUP107	P57740	925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2H	P62256	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FMO1	Q01740	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ACY1	Q03154	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CACNG1	Q06432	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GBX1	Q14549	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CAMK4	Q16566	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CPT1B	Q92523	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768		A8MVJ9	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	IKBKB	O14920	756 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CALCA	P01258	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	UMOD	P07911	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	UQCRH	P07919	91 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FPR3	P25089	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	HADHA	P40939	763 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	STX17	P56962	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DAOA	P59103	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PSG6	Q00889	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PMPCA	Q10713	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PEX6	Q13608	980 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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