RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 DERL2Q9GZP9 239 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CD274Q9NZQ7 290 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RNF112Q9ULX5 631 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LRRK2Q5S007 2527 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH17O14917 1159 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CLGNO14967 610 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RDH16O75452 317 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ICAM2P13598 275 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CD1DP15813 335 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ALOX12P18054 663 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CRABP2P29373 138 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SCTRP47872 440 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HSPA7P48741 367 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RAB8AP61006 207 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NAB1Q13506 487 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB134Q4QY38 66 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MROH9Q5TGP6 573 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD13Q7L211 337 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KRT78Q8N1N4 520 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ESAMQ96AP7 390 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MOCOSQ96EN8 888 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CYTH2Q99418 400 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RHBGQ9H310 441 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PELI2Q9HAT8 420 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.87□□□□□ -1.15
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PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DYTNA2CJ06 578 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OR2W5A6NFC9 320 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 A8MUI8 341 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CHST10O43529 356 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 B4GALT2O60909 372 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SUPT3HO75486 399 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 STK16O75716 305 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA7P05543 415 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PRR35P0CG20 571 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 COX6A1P12074 109 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TFEBP19484 476 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 IL10P22301 178 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GNLYP22749 145 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 JAK1P23458 1154 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AHRP35869 848 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CD97P48960 835 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AGTR2P50052 363 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GYS2P54840 703 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 VSNL1P62760 191 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AP2B1P63010 937 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OLR1P78380 273 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ARG2P78540 354 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 REEP5Q00765 189 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 Q0VFX4 171 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CDC16Q13042 620 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OR4D1Q15615 310 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NSDHLQ15738 373 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 BTBD16Q32M84 506 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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