RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC38Q502W7 563 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF534Q76KX8 674 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM73Q86UV7 250 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 HOOK3Q86VS8 718 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAB43Q86YS6 212 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR135Q8IZ08 494 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PEX13Q92968 403 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 HDAC10Q969S8 669 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CAPZA3Q96KX2 299 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF778Q96MU6 729 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GBP5Q96PP8 586 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MENTQ9BUN1 341 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR10A5Q9H207 317 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 EMC7Q9NPA0 242 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR83Q9NYM4 423 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ASF1AQ9Y294 204 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 C9orf118A6NHY6 69 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 A6NL46 340 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ISM1B1AKI9 464 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 F8W8V4 182 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KDM1AO60341 852 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DPM1O60762 260 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KLHL18O94889 574 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLCO2B1O94956 709 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ONECUT2O95948 504 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPN2P04844 631 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 UMODP07911 640 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD99P14209 185 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD9P21926 228 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADRA1DP25100 572 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PKLRP30613 574 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OTX2P32243 289 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 FDFT1P37268 417 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOLR3P41439 243 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PAFAH1B1P43034 410 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAB28P51157 221 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 RRADP55042 308 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SOX8P57073 446 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL13RA1P78552 427 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 CD83Q01151 205 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEMA3AQ14563 771 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYBPC3Q14896 1274 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 KYNUQ16719 465 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DEFB110Q30KQ9 67 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 C1orf189Q5VU69 101 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MLIPQ5VWP3 458 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRGPREQ86SM8 312 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 VRK3Q8IV63 474 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SYT8Q8NBV8 401 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPATA4Q8NEY3 305 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR4L1Q8NH43 312 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC8-202ENST00000577426 ASZ1Q8WWH4 475 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms