RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568875.1

SNAPC5-208, Transcript of small nuclear RNA activating complex polypeptide 5, human

TSL 2

Gene SNAPC5, Length 1,741 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAPC5-208	ENST00000568875	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	NME5	P56597	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	NRF1	Q16656	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SNAPC5-208	ENST00000568875	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PDLIM1	O00151	329 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CDC7	O00311	574 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	E2F3	O00716	465 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CLGN	O14967	610 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	AKAP10	O43572	662 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	BMP10	O95393	424 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	MYF6	P23409	242 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	EPHA4	P54764	986 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	EMX2	Q04743	252 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CACNG1	Q06432	222 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	NFYC	Q13952	458 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	KCNA7	Q96RP8	456 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CMKLR1	Q99788	373 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CIB1	Q99828	191 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ALG2	Q9H553	416 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ARPC2	O15144	300 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	TIPRL	O75663	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	OR6B1	O95007	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	VIP	P01282	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PCSK2	P16519	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ITGAL	P20701	1170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	AKT1	P31749	480 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	GSK3B	P49841	420 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	DIO3	P55073	304 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	PRKG2	Q13237	762 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	GK3P	Q14409	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SNAPC5-208	ENST00000568875	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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