RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ISCA2Q86U28 154 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP112Q8N8E3 955 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 MOCOSQ96EN8 888 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFRPQ9BY79 579 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLAAQ9Y263 795 aa16.15■□□□□ 0.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYCE1LA8MT33 242 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAPBPO15533 448 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS4BO75351 444 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TFEBP19484 476 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFAP5Q13361 173 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCOLCEQ15113 449 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDK4Q16654 411 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFT81Q8WYA0 676 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR34Q96EX3 536 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALG9Q9H6U8 611 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS4AQ9UN37 437 aa16.14■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 JRKO75564 520 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 FHP07954 510 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPA7P48741 367 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB8P50452 374 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAPTM5Q13571 262 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBCCQ15814 346 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 MROH9Q5TGP6 573 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 163.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX31Q8N9S9 440 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM10Q96HG1 83 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD244Q9BZW8 370 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRK2Q5S007 2527 aa16.13■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 RELNP78509 3460 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A088AWK7 358 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHST10O43529 356 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC3AO75596 197 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 WFS1O76024 890 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2P06681 752 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 INHBAP08476 426 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOX11P35716 441 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB9P50453 376 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFNA3P52797 238 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHAGQ02094 409 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 HYAL2Q12891 473 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLG1Q12959 904 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLC3Q6P597 504 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEX11GQ96HA9 241 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX15Q9NRS6 342 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 LANCL2Q9NS86 450 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.12■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.11■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 DYTNA2CJ06 578 aa16.11■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMX2A2RU54 273 aa16.11■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.11■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPT3HO75486 399 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms