RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM155B	O75949	473 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR47	O94967	919 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GALT4	O96024	378 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPIND1	P05546	499 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGAM	P11215	1152 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAZ	P19086	355 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GLRB	P48167	497 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V0D1	P61421	351 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	RHAG	Q02094	409 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1N	Q8N819	430 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPV3	Q8NET8	790 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX11G	Q96HA9	241 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA6	P08185	405 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	STX2	P32856	288 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNC1	P48547	511 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	AGTR2	P50052	363 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	NR6A1	Q15406	480 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD13	Q7L211	337 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	GPSM1	Q86YR5	675 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	HAS2	Q92819	552 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL31	Q9H511	634 aa		20.52	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf51	C9J302	202 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST10	O43529	356 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF4	O60810	478 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	FH	P07954	510 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	GMPR	P36959	345 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	AP2B1	P63010	937 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	OLR1	P78380	273 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC16	Q13042	620 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	NAB1	Q13506	487 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	C8orf74	Q6P047	294 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PDPR	Q8NCN5	879 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1191	Q96A73	305 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CNDP1	Q96KN2	507 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	WFS1	O76024	890 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF10	P50591	281 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SKP1	P63208	163 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	DLG1	Q12959	904 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	20.5	■□□□□ 0.87	6e-8	■■■□□ 19.1
PPP4C-205	ENST00000563200	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	FHL5	Q5TD97	284 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	20.5	■□□□□ 0.87	7e-6	■■■■■ 46.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF32	Q9H0A6	362 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	EHD1	Q9H4M9	534 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		20.5	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	URAD	A6NGE7	173 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA7A	O75326	666 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	HNF4A	P41235	474 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB8A	P61006	207 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ARG2	P78540	354 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	NSDHL	Q15738	373 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ISCA2	Q86U28	154 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TSLP	Q969D9	159 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ESAM	Q96AP7	390 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5DC2	Q9H857	520 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		20.49	■□□□□ 0.87

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