RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	GPD1L	Q8N335	351 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	CALML4	Q96GE6	196 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	SFXN2	Q96NB2	322 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	PAFAH2	Q99487	392 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	SEPHS2	Q99611	448 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	MAP3K3	Q99759	626 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	OLFM1	Q99784	485 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	ATF6B	Q99941	703 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685		Q9N2K0	584 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RRN3-204	ENST00000561685	TRIO	O75962	3097 aa		2.59	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		2.59	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	FRY	Q5TBA9	3013 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SPEG	Q15772	3267 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SHISA7	A6NL88	538 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ZZEF1	O43149	2961 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SMIM18	P0DKX4	95 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	GP9	P14770	177 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	MTHFR	P42898	656 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	UBXN2A	P68543	259 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ADCK1	Q86TW2	530 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	KCNMB4	Q86W47	210 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	MMD2	Q8IY49	270 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	POC5	Q8NA72	575 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	THAP8	Q8NA92	274 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	LPGAT1	Q92604	370 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SPDL1	Q96EA4	605 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TIGD1	Q96MW7	591 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	NARF	Q9UHQ1	456 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	LAMB1	P07942	1786 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		2.58	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	NEMP2	A6NFY4	417 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685		K7EQD1	137 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	RTL8C	O15255	209 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	HP	P00738	406 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	IGHV2-70	P01814	119 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	BCL3	P20749	454 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	NRIP1	P48552	1158 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	DNA2	P51530	1060 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	PTPN14	Q15678	1187 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	OLFM4	Q6UX06	510 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	KBTBD6	Q86V97	674 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	LGI2	Q8N0V4	545 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	ATL1	Q8WXF7	558 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TEX12	Q9BXU0	123 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	OPA3	Q9H6K4	179 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685		R4GN57	208 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	TONSL	Q96HA7	1378 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	FAM186A	A6NE01	2351 aa		2.57	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	PLXNA3	P51805	1871 aa		2.56	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		2.56	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	FRYL	O94915	3013 aa		2.56	□□□□□ -2
RRN3-204	ENST00000561685	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		2.56	□□□□□ -2

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