RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 PAFAH2Q99487 392 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CD244Q9BZW8 370 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 LHPPQ9H008 270 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 EHD1Q9H4M9 534 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 KLHL31Q9H511 634 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 LANCL2Q9NS86 450 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 NFU1Q9UMS0 254 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 A0A096LPK6 155 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 OR2W5A6NFC9 320 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 SUPT3HO75486 399 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 S100BP04271 92 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 SERPINA6P08185 405 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CD22P20273 847 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CXCR2P25025 360 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 AGTR2P50052 363 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 OLR1P78380 273 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ABHD13Q7L211 337 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 AMER2Q8N7J2 671 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 SNX31Q8N9S9 440 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PEX11GQ96HA9 241 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 GPR78Q96P69 363 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 OR1F2PQ96R84 312 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 NT5DC2Q9H857 520 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 LUZP4Q9P127 313 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PLAAQ9Y263 795 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CLGNO14967 610 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CELA2AP08217 269 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 INHBAP08476 426 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PRR35P0CG20 571 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 HNF4AP41235 474 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 GLRBP48167 497 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RAB8AP61006 207 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RHAGQ02094 409 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 DOC2AQ14183 400 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 E2F2Q14209 437 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ADNP2Q6IQ32 1131 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PSMF1Q92530 271 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CLMPQ9H6B4 373 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CCDC189A1A4V9 331 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 URADA6NGE7 173 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TTLL8A6PVC2 850 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 CHST10O43529 356 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 KLHL2O95198 593 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 GSTM2P28161 218 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TYK2P29597 1187 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 SKP1P63208 163 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 KCNC4Q03721 635 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ACAP2Q15057 778 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 XKR6Q5GH73 641 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 IFT20Q8IY31 132 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 KRT78Q8N1N4 520 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TTLQ8NG68 377 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 TM9SF4Q92544 642 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 AGAP4Q96P64 663 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 FLNCQ14315 2725 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 NBASA2RRP1 2371 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-219ENST00000550655 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms