RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ATL1Q8WXF7 558 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 EXT2Q93063 718 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ESAMQ96AP7 390 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 GBP5Q96PP8 586 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 OR2A5Q96R48 311 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PAFAH2Q99487 392 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 GPR87Q9BY21 358 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 FUT8Q9BYC5 575 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ACTL8Q9H568 366 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SNX15Q9NRS6 342 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CUTCQ9NTM9 273 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CD274Q9NZQ7 290 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TLK1Q9UKI8 766 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ACOT9Q9Y305 439 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 A0A096LPK6 155 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 C21orf140B9A014 251 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TAPBPO15533 448 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RIPK2O43353 540 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 DNAJB5O75953 348 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 WDR47O94967 919 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PRF1P14222 555 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TFEBP19484 476 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CCND1P24385 295 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 GLRBP48167 497 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ATP6V0D1P61421 351 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CDKL1Q00532 357 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SLC29A2Q14542 456 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 HKDC1Q2TB90 917 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ISCA2Q86U28 154 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NEIL2Q969S2 332 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 KIAA1191Q96A73 305 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CABS1Q96KC9 395 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 HAUS8Q9BT25 410 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NLNQ9BYT8 704 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 VPS11Q9H270 941 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ALG9Q9H6U8 611 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 C12orf49Q9H741 205 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 LUZP4Q9P127 313 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RNF112Q9ULX5 631 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 POLHQ9Y253 713 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MTORP42345 2549 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 A0A087X1B8 175 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GX78 115 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 FITM1A5D6W6 292 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 C9J4A7 227 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 DSCR3O14972 297 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 P2RX6O15547 441 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 OR1F1O43749 312 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ITGAXP20702 1163 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 HRH2P25021 359 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 BCL6P41182 706 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 HSPA7P48741 367 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 HNMTP50135 292 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SERPINB9P50453 376 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CCR8P51685 355 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RELAQ04206 551 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms