RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CHKB	Q9Y259	395 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM17	Q9Y577	477 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0B4J203	849 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ASPDH	A6ND91	283 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CCL24	O00175	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC28A2	O43868	658 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE9A	O76083	593 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ALPP	P05187	535 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD2	P08910	425 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ALPPL2	P10696	532 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2A7	P20853	494 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RABIF	P47224	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP1	Q07960	439 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF10	Q12962	218 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PDK1	Q15118	436 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD11	Q693B1	232 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF410	Q86VK4	478 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LGI2	Q8N0V4	545 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	URGCP	Q8TCY9	931 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM46B	Q96A09	425 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF21B	Q96EK2	531 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RASL10B	Q96S79	203 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RUFY1	Q96T51	708 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NDN	Q99608	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf21	Q9H246	121 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNK6	Q9Y257	313 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	EVPL	Q92817	2033 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NOTCH4	Q99466	2003 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ARPC2	O15144	300 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	REC8	O95072	547 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	OAZ2	O95190	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CXCL14	O95715	111 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	BAG3	O95817	575 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	FCGR1A	P12314	374 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SCP2	P22307	547 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	AHCY	P23526	432 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NF2	P35240	595 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SMS	P52788	366 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNG1	Q06432	222 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SULT2A1	Q06520	285 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC38	Q5VT99	294 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4A47	Q6IF82	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ASPG	Q86U10	573 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SFR1	Q86XK3	245 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CNPY4	Q8N129	248 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX9	Q8N6V9	391 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD17B8	Q92506	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	BICD1	Q96G01	975 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRG7	Q96K78	797 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ACTL8	Q9H568	366 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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