RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527333.5

CKAP5-208, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene CKAP5, Length 498 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-208ENST00000527333 KRT6AP02538 564 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 KRT6BP04259 564 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 BCKDHAP12694 445 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 ACP5P13686 325 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 SLC2A4P14672 509 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 SLC6A2P23975 617 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 TACR1P25103 407 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 SSTR4P31391 388 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 KRT6CP48668 564 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 C21orf59P57076 290 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 C21orf58P58505 322 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 STX1BP61266 288 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 ATG9BQ674R7 924 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 LCTLQ6UWM7 567 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 NEIL2Q969S2 332 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 TMEM131Q92545 1883 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP5-208ENST00000527333 CLCA4Q14CN2 919 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 KIF19Q2TAC6 998 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 SGO1Q5FBB7 561 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 LAYNQ6UX15 382 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 NRROSQ86YC3 692 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP5-208ENST00000527333 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
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