RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 CD209Q9NNX6 404 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MIOSQ9NXC5 875 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GCNT4Q9P109 453 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 BTAF1O14981 1849 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SIPA1L1O43166 1804 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.11□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TAF1LQ8IZX4 1826 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 NOTCH2Q04721 2471 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 CCDC169A6NNP5 214 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 J3QR06 171 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DNM1LO00429 736 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 P4HA2O15460 535 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 HCRTR2O43614 444 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCDC172P0C7W6 258 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 CHRNA3P32297 505 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 HPDP32754 393 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DNA2P51530 1060 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ZNF131P52739 623 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GALCP54803 685 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 KLC3Q6P597 504 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 FAM228AQ86W67 206 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CCDC114Q96M63 670 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ERP44Q9BS26 406 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 AMACRQ9UHK6 382 aa4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 RARGP13631 454 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TMOD1P28289 359 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RDXP35241 583 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 NCALDP61601 193 aa4.09□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 MYL7Q01449 175 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DR1Q01658 176 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CDR2Q01850 454 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GAGE2BQ13066 116 aa4.09□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 GAGE2EQ4V326 116 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.09□□□□□ -1.75
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SGCE-211ENST00000522045 TSPAN33Q86UF1 283 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 HACE1Q8IYU2 909 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 LSMEM2Q8N112 164 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PRELID2Q8N945 189 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 OR2T11Q8NH01 316 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 METTL6Q8TCB7 284 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 SUSD6Q92537 303 aa4.09□□□□□ -1.75
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