RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WIPF3A6NGB9 483 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHST10O43529 356 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIAS1O75925 651 aa14.26□□□□□ -0.13
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CELA2AP08217 269 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC166P0CW27 439 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GSTM2P28161 218 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2orf54Q08AI8 447 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TGFBIQ15582 683 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPSM1Q86YR5 675 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.26□□□□□ -0.13
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LPAR4Q99677 370 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR22Q99680 433 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBBP8Q99708 897 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5H15A6NDH6 313 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2W5A6NFC9 320 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A8MUI8 341 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC6A12P48065 614 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF33BQ06732 778 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFT2D3Q587I9 215 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACER2Q5QJU3 275 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRTP1Q5TC63 336 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT78Q8N1N4 520 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM10Q96HG1 83 aa14.25□□□□□ -0.13
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 C5orf34Q96MH7 638 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NT5DC2Q9H857 520 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNK13Q9HB14 408 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MMP25Q9NPA2 562 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OLAHQ9NV23 265 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABI3Q9P2A4 366 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDK2AP1O14519 115 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRMT3O60678 531 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STX2P32856 288 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNF4AP41235 474 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDF5P43026 501 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEA4P43358 317 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4D2P58180 307 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPX6P59796 221 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB10P61026 200 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HYAL2Q12891 473 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHISA5Q8N114 240 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA1191Q96A73 305 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAR2Q96K12 515 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EHD1Q9H4M9 534 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COPG2Q9UBF2 871 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A088AWK7 358 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 E2F3O00716 465 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLGNO14967 610 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
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