RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PTPRD	P23468	1912 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	OGT	O15294	1046 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC16A4	O15374	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	REC8	O95072	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ABCD3	P28288	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MED8	Q96G25	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	BPTF	Q12830	3046 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MYH11	P35749	1972 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TSC2	P49815	1807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HS3ST1	O14792	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	YKT6	O15498	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PCDH7	O60245	1069 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MED24	O75448	989 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	NOL4	O94818	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SFTPC	P11686	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF23	P17027	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CYP2F1	P24903	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ADSS	P30520	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	AHR	P35869	848 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LHX1	P48742	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LY6D	Q14210	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ASB7	Q9H672	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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