RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ARL15Q9NXU5 204 aa11.31□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 MEMO1Q9Y316 297 aa11.31□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF860A6NHJ4 632 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PRRG2O14669 202 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFS4O43181 175 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CHST10O43529 356 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PRMT3O60678 531 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 B4GALT2O60909 372 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ALOX12P18054 663 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SSTR2P30874 369 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 MAGEA3P43357 314 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CYB561P49447 251 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SLC26A5P58743 744 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 IL2P60568 153 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 RGS1Q08116 209 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CSHL1Q14406 222 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB134Q4QY38 66 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ABHD13Q7L211 337 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SHISA5Q8N114 240 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 GHDCQ8N2G8 530 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ATL1Q8WXF7 558 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PBKQ96KB5 322 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 FRMD6Q96NE9 622 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PTCHD1Q96NR3 888 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NDNQ99608 321 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NPAS2Q99743 824 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 LANCL2Q9NS86 450 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 GTF3C1Q12789 2109 aa11.3□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TRBC2A0A5B9 178 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 URADA6NGE7 173 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NRDCO43847 1150 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 MAN1A2O60476 641 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NEURL1O76050 574 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TTC4O95801 387 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TSPAN12O95859 305 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PGAM1P18669 254 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 AP1S2P56377 157 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ELP5Q8TE02 316 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TSLPQ969D9 159 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PYCR2Q96C36 320 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 LINGO1Q96FE5 620 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 MS4A14Q96JA4 679 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 OLFM1Q99784 485 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NAT9Q9BTE0 207 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SARGQ9BW04 601 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.29□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 FBN2P35556 2912 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 E9PLN8 166 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 FCHO1O14526 889 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NME2P1O60361 137 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A12O75746 678 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 AHSGP02765 367 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF24P17028 368 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CAPN3P20807 821 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 NME2P22392 152 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 AHRP35869 848 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 HLCSP50747 726 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CDKN2DP55273 166 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CRYMQ14894 314 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PPP1R7Q15435 360 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CYP1B1Q16678 543 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 PHKG1Q16816 387 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 SIAH3Q8IW03 269 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 CEP97Q8IW35 865 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 POGLUT1Q8NBL1 392 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 TRPV3Q8NET8 790 aa11.28□□□□□ -0.6
CNOT4-211ENST00000498534 OR56A3Q8NH54 315 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms