RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRR3	A8MPY1	467 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNDC9	O14530	226 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD3	O43242	534 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF2	O75151	1096 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM155B	O75949	473 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO2B1	O94956	709 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf105	O95561	183 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SP1	P08047	785 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK2	P20151	261 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	IST1	P53990	364 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FOLH1	Q04609	750 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM14	Q14142	442 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00523	Q86TU6	105 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4L1	Q8NH43	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NRGN	Q92686	78 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SCMH1	Q96GD3	660 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC7	Q99615	494 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CHP1	Q99653	195 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LRFN1	Q9P244	771 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	INTU	Q9ULD6	942 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NFS1	Q9Y697	457 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH6	A6NGR9	719 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNA5	O15131	536 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PJA2	O43164	708 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNDBP1	O95273	360 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	AOAH	P28039	575 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNB4	P30926	498 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGS2	P35354	604 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	AGTR2	P50052	363 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EXT1	Q16394	746 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	P3H1	Q32P28	736 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SIAH3	Q8IW03	269 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ACBD4	Q8NC06	268 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SMPDL3A	Q92484	453 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RND1	Q92730	232 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT35	Q92764	455 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CYTH2	Q99418	400 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	DNHD1	Q96M86	4753 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RQJ8	604 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPV9	198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM10	O14672	748 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NDC80	O14777	642 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXS1	O43638	330 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A12	O75746	678 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TJP3	O95049	919 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL18	O95568	372 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGER1	P34995	402 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	XCR1	P46094	333 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH17	Q12864	832 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PTK6	Q13882	451 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD11	Q693B1	232 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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