RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPH1Q70E73 1250 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 OR1F2PQ96R84 312 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CD274Q9NZQ7 290 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CHST10O43529 356 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJB6O75190 326 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SERPINA6P08185 405 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ITGAMP11215 1152 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SOX11P35716 441 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 GGT5P36269 586 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 GMPRP36959 345 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA7P48741 367 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 AGTR2P50052 363 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB8AP61006 207 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 OLR1P78380 273 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 HYAL2Q12891 473 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TLR1Q15399 786 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 AMER2Q8N7J2 671 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 EXT2Q93063 718 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1191Q96A73 305 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 KLHL31Q9H511 634 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 LANCL2Q9NS86 450 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF112Q9ULX5 631 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 FLNCQ14315 2725 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 DYTNA2CJ06 578 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CLGNO14967 610 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 STK16O75716 305 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 FHP07954 510 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CRABP2P29373 138 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ARG2P78540 354 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 RHAGQ02094 409 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 DLG1Q12959 904 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 NSDHLQ15738 373 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT78Q8N1N4 520 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SNX31Q8N9S9 440 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TTLQ8NG68 377 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ESAMQ96AP7 390 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ALG9Q9H6U8 611 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-211ENST00000493436 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TFEBP19484 476 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 JAK1P23458 1154 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNC1P48547 511 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NR6A1Q15406 480 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 BTBD16Q32M84 506 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 SFT2D3Q587I9 215 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 FHL5Q5TD97 284 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PDPRQ8NCN5 879 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 MNS1Q8NEH6 495 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CCT6BQ92526 530 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TSLPQ969D9 159 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM10Q96HG1 83 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRK2Q5S007 2527 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms