RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462721.5

DMKN-222, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 970 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CLGN	O14967	610 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TFEB	P19484	476 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PHB	P35232	272 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	RAB8A	P61006	207 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	MFAP5	Q13361	173 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71	2e-7	■■■■□ 20.3
DMKN-222	ENST00000462721	NSDHL	Q15738	373 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CUZD1	Q86UP6	607 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	AMER2	Q8N7J2	671 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TTL	Q8NG68	377 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	OR1F2P	Q96R84	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CD244	Q9BZW8	370 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ALG9	Q9H6U8	611 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	NT5DC2	Q9H857	520 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	WWOX	Q9NZC7	414 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721		A0A087X1B8	175 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	LRIT2	A6NDA9	550 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	C2	P06681	752 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	FH	P07954	510 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CELA2A	P08217	269 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	GNLY	P22749	145 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	AGTR2	P50052	363 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	AP2B1	P63010	937 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	OLR1	P78380	273 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	BTN3A2	P78410	334 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	RHAG	Q02094	409 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	DOC2A	Q14183	400 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TLR1	Q15399	786 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	XKR6	Q5GH73	641 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	SNX31	Q8N9S9	440 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	HAS2	Q92819	552 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	WDR34	Q96EX3	536 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	AICDA	Q9GZX7	198 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	EHD1	Q9H4M9	534 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	COPG2	Q9UBF2	871 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DMKN-222	ENST00000462721	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721		A8MUI8	341 aa		10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	PRMT3	O60678	531 aa		10.58	□□□□□ -0.72
DMKN-222	ENST00000462721	B4GALT2	O60909	372 aa		10.58	□□□□□ -0.72

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