RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP26Q9BV47 211 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CHID1Q9BWS9 393 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 REEP4Q9H6H4 257 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 CD93Q9NPY3 652 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 VNN3Q9NY84 501 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KLF15Q9UIH9 416 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ICKQ9UPZ9 632 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 INVSQ9Y283 1065 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ASF1AQ9Y294 204 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 POM121BA6NF01 834 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf51C9J302 202 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 H3BNH8 94 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CLIC1O00299 241 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EI24O14681 340 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FPGTO14772 594 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 TNFAIP8O95379 198 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 RECKO95980 971 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 DCTP40126 519 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GCGRP47871 477 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RAB28P51157 221 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ARFIP1P53367 373 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SEC13P55735 322 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 STARD3Q14849 445 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 MAPK11Q15759 364 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RPE65Q16518 533 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 PGS1Q32NB8 556 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GCNT7Q6ZNI0 430 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.4□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
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