RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA7P48741 367 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMP2P54851 167 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHEXP78562 749 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFKB2Q00653 900 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IRF8Q02556 426 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLRB1Q12918 225 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLG1Q12959 904 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYBPC3Q14896 1274 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LIPJQ5W064 366 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TDRPQ86YL5 185 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNT16Q8N428 558 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX31Q8N9S9 440 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NXNL1Q96CM4 212 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS11Q9H270 941 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPT2Q9UMR5 302 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BSNQ9UPA5 3926 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ESPNB1AK53 854 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBXN8O00124 270 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOCS6O14544 535 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDH16O75309 829 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WFS1O76024 890 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BMP10O95393 424 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED26O95402 600 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HEXBP07686 556 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL1RNP18510 177 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAC1P20366 129 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIK3CBP42338 1070 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GDF5P43026 501 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XCR1P46094 333 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNC1P48547 511 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFATC3Q12968 1075 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHIT1Q13231 466 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC29A2Q14542 456 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XKR6Q5GH73 641 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPZQ66K79 652 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR93Q6P2C0 686 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED27Q6P2C8 311 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMBQ6PCB8 327 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM205Q6UW68 189 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF605Q86T29 641 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAS2Q8IYD9 372 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCT2Q8NC54 265 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2L5Q8NG80 312 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXT2Q93063 718 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC126Q96EE4 140 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF31Q96EP0 1072 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAR2Q96K12 515 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR78Q96P69 363 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNC2Q96PR1 638 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LHPPQ9H008 270 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.11□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms